使い方ガイド
SMILES（Simplified Molecular Input Line Entry System）は、有機化合物の構造を1行のテキストで表現するための記法です。 データベース検索・プログラム処理・論文補足情報への記載など、幅広い場面で使用されます。
基本ルール:
- 原子: 元素記号そのまま（C, N, O, S, F, Cl, Br, I）。小文字は芳香族原子（c, n, o）
- 結合: 単結合は省略、二重結合は
=、三重結合は# - 環: 環の閉じる位置に同じ数字を書く（例:
C1CCCCC1= シクロヘキサン） - 分岐: 括弧
()で表現（例:CC(C)C= イソブタン） - 電荷:
[NH4+]（正電荷）、[O-]（負電荷） - 水素: 通常省略。明示する場合は
[CH3]のように角括弧内に
代表例:
- エタノール:
CCO - ベンゼン:
c1ccccc1 - アスピリン:
CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O - グリシン:
NCC(=O)O
参考: Weininger, D. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1988, 28, 31–36.