Molflow3D
有機化学ツールキット

使い方ガイド

100%
C2H6
30.07
CC
※セルを選んでから押すと末尾文字を変換(脚注 a,b,c も可)

収率列の最高値は自動で強調されます(図出力では太字)。Entry列は自動採番。⧉で行を複製して条件を1つだけ変える、が最速の入力方法です。

NMRデータ整形(ACS形式)

δ (ppm)多重度J (Hz)H数

HRMS計算・整形

精密質量(最多同位体)から付加体のm/zを自動計算。ドロータブの分子式バーにもexact massを表示しています。

Bocアミン
導入Boc₂O, Et₃N(または NaHCO₃ aq)
脱保護TFA / 4M HCl–ジオキサン

酸で外れる。塩基・求核剤・接触水素化に安定

Fmocアミン
導入Fmoc-Cl または Fmoc-OSu, 塩基
脱保護20% ピペリジン/DMF

塩基で外れる。酸に安定。SPPSの定番

Cbz (Z)アミン
導入Cbz-Cl, 塩基
脱保護H₂, Pd/C

水素化分解。酸・塩基に比較的安定

Acアミン
導入Ac₂O または AcCl, 塩基
脱保護強酸/強塩基で加水分解

外しにくいので一時保護には不向きなことも

Tsアミン
導入TsCl, ピリジン
脱保護Na/ナフタレン, Mg/MeOH 等

非常に頑丈。脱保護条件が過酷

TMSアルコール
導入TMSCl, イミダゾール
脱保護K₂CO₃/MeOH, 希酸, F⁻

最も外れやすいシリル。仮保護向き

TBS (TBDMS)アルコール
導入TBSCl, イミダゾール/DMF
脱保護TBAF/THF, HF·py

汎用シリル。酸性条件にはやや弱い

TIPSアルコール
導入TIPSCl, イミダゾール
脱保護TBAF

TBSより酸に強い。1級OH選択的

TBDPSアルコール
導入TBDPSCl, イミダゾール
脱保護TBAF(遅め)

酸に最も強いシリル級。かさ高い

Bnアルコール
導入BnBr, NaH/DMF
脱保護H₂, Pd/C

酸塩基に強い。水素化で除去

PMBアルコール
導入PMB-Cl, NaH(または PMB-トリクロロアセトイミダート)
脱保護DDQ / CAN

Bnと直交。酸化的に外せる

MOMアルコール
導入MOMCl, DIPEA
脱保護HCl/MeOH, TMSBr

酸で除去。塩基に安定

THPアルコール
導入DHP, PPTS(cat.)
脱保護PPTS/MeOH

安価。ジアステレオマー混合物になる点に注意

Acアルコール
導入Ac₂O, ピリジン/DMAP
脱保護K₂CO₃/MeOH

穏和に着脱可能。塩基性条件に弱い

Tr (トリチル)アルコール
導入TrCl, ピリジン
脱保護希酸(AcOH aq 等)

1級OH選択的。かさ高い

1,3-ジオキソランカルボニル
導入エチレングリコール, TsOH, Dean–Stark
脱保護希酸水溶液 / アセトン, PPTS

アセタール保護の定番。塩基・求核剤に安定

1,3-ジチアンカルボニル
導入1,3-プロパンジチオール, BF₃·OEt₂
脱保護Hg(II)塩, MeI, 酸化剤

アンポール化(umpolung)にも利用可

Meエステルカルボン酸
導入MeOH/H₂SO₄ または TMSCHN₂
脱保護LiOH または NaOH aq

最小・安価。塩基加水分解で除去

tBuエステルカルボン酸
導入イソブチレン/H₂SO₄, Boc₂O/DMAP
脱保護TFA

酸で外れる。塩基加水分解に強い

Bnエステルカルボン酸
導入BnBr, K₂CO₃
脱保護H₂, Pd/C

中性条件(水素化)で除去できる

※ 代表的な条件のみ。基質依存性があるため一次文献(Greene's PG 等)で要確認。

Nudged Elastic Band (NEB) 法で反応経路・遷移状態を探索します(IDPP 初期経路 + Climbing Image + FIRE、解析勾配、Web Worker 実行)。 ✏️「ここで描く」から直接描画するか、描画タブで保存したスケッチ・DFT 出力を読み込んでください。

構造設定

原料 (R)
未設定
生成物 (P)
未設定

計算パラメータ

中間イメージ数
8
ばね定数 k
2
最大ステップ数
400
収束判定 fTol (kcal/mol/Å)
0.5
初期経路:最適化:
エネルギー計算: ※ 力場を組める構造(描画由来)が無いため、デモポテンシャルで実行されます

🧮 DFT 結果から反応エネルギー図

Gaussian / ORCA / xtb の出力(R・TS・P)を読み込むと、ΔE‡・ΔG‡・ΔE・ΔG (kcal/mol) と虚振動の有無を表示します。

原料 (R)
遷移状態 (TS)
生成物 (P)

Draw タブで構造式を描いた後、ツールバーの「3D」ボタンをクリックすると MMFF94 ライク力場で座標を最適化し、3D モデルを表示します。

  • 回転: 左ドラッグ
  • ズーム: マウスホイール
  • パン: 右ドラッグ
  • 表示モード: ボール&スティック / スティック / 空間充填モデルを切替
  • CPK カラー: 元素に応じた標準色（C=グレー、N=青、O=赤など）

※ 力場最適化は軽量な近似計算です。量子化学計算の代替ではありません。